Au sein du krosmoz, il y a une planète baptisée "le monde des douze". Douze, car c'est le nombre de dieux qui ont participé à sa création. Malgré son jeune âge, d'à peine quelques milliers d'années, le monde des douze a été le théâtre de terribles évènements. Le plus terrible d'entre eux, "le chaos d'Ogrest", a déclenché un cataclysme sans précédent, innondant les continents et ne laissant subsister que quelques archipels. Les plus éminents érudits restent sceptiques, et se demandent encore par quel mystère ce monde n'a pas sombré dans les confins du krosmoz...Les immortels et les dragons savent,quant à eux, que c'est grâce au wakfu, l'énergie magique et spirituelle se situant dans toute chose.

Voilà 12 ans que l'orphelin Yugo a été confié au chasseur de primes Alibert. Il coulent des jours tranquilles à l'auberge du Bouftou Croustillant. Mais la tranquillité ne va pas rester très longtemps: Yugo va découvrir qu'il est capable de créer des portails de téléportation. Il va partir en quête de sa vraie famille avec ses nouveaux amis, Tristepin de Percedal, Ruel Stroud, Amalia Sheran Sharm et Evangelyne la Crâ.

Saison 1:

Alors que Yugo vient de découvrir ses pouvoirs et part retrouver sa vraie famille avec ses nouveaux amis, Nox le Xélor, est à la recherche du dragon qui a confié Yugo à Alibert. Ce Xélor le cherche car les dragons sont la plus grande source de Wakfu du monde des douze, et il en a besoin pour alimenter sa machine. Yugo et ses amis vont devoir affronter plusieurs obstacles avant d'être enfin sur l'île d'Oma, leur destination finale. Mais Nox compte bien ne pas laisser ce petit éliatrope faire sa route sans encombres...

Saison 2:

Yugo et ses amis se remettent peu à peu de la mort de Tristepin et reprennent leur vie tranquille. Mais Évangelyne n'arrive pas à accepter que le guerrier est mort. Son imagination lui jouerait des tours ? Yugo et Adamaï, avec l'Éliacube  délivrent un certain Qilby de la dimension dans laquelle il était enfermé. Il prétend être le roi Éliatrope. Il donne une nouvelle quête à Yugo: retrouver son Dofus de Sauvegarde situé à l'archipel des Griffes Pourpres, afin qu'il puisse créer un portail pour délivrer les enfants Éliatropes. Mais il semblerait que Qilby cache quelque chose...